它包括:多光子荧光检测系统、共聚焦检测系统、光谱扫描检测系统、计算机软硬件系统等部分。
双光子扫描显微镜是结合激光扫描共聚焦显微镜和双光子激发技术的一种新技术,其优点表现在:① 两种不同波长的光交迭导致信号空间区域化, 可与背景形成对比; ② 因为荧光强度与入射光强度的平方成正比, 所以两束光单独激发的信号不可能超出原来的四倍, 但两束光同时激发却可以使信号增强1000 倍, 即小目标物经过较大散射媒质后更容易观察; ③ 与双光子激发比较, 双色激发在焦点内荧光散射增加, 而干扰背景荧光只有很小增加。